Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CXCL9Q07325 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms