Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC18A2Q05940 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC18A2Q05940 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms