Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GCNT1Q02742 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms