Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IFITM3Q01628 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms