Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RAB25P57735 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB25P57735 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB25P57735 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms