Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC13P55735 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC13P55735 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC13P55735 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC13P55735 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms