Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERFP50548 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERFP50548 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERFP50548 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERFP50548 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERFP50548 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERFP50548 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERFP50548 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ERFP50548 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms