Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HOXA1P49639 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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HOXA1P49639 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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