Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA11P31270 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA11P31270 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms