Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PTPRDP23468 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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