Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMD1P17707 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMD1P17707 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMD1P17707 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AMD1P17707 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AMD1P17707 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMD1P17707 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMD1P17707 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMD1P17707 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AMD1P17707 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms