Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRF1P14222 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PRF1P14222 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRF1P14222 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRF1P14222 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRF1P14222 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PRF1P14222 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRF1P14222 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRF1P14222 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRF1P14222 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRF1P14222 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms