Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTDSP2O14595 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTDSP2O14595 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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