Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PTPRQQ9UMZ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PTPRQQ9UMZ3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms