Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNK4Q9NYG8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms