Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MED17Q9NVC6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms