Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTPS2Q9NRF8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms