Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms