Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRIM54Q9BYV2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms