Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
RETNLBQ9BQ08 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms