Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEMA3CQ99985 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SEMA3CQ99985 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms