Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TRAPPC9Q96Q05 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TRAPPC9Q96Q05 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms