Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JSRP1Q96MG2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JSRP1Q96MG2 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms