Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MTERF3Q96E29 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
MTERF3Q96E29 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms