Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FAM3CQ92520 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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