Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSH3Q8TE77 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms