Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD163Q86VB7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms