Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LRIG3Q6UXM1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LRIG3Q6UXM1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms