Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL35Q6PF15 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms