Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
CSAG1Q6PB30 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms