Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GKAP1Q5VSY0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms