Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY80

CATSPERE, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPEREQ5SY80 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CATSPEREQ5SY80 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CATSPEREQ5SY80 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms