Protein–RNA interactions for Protein: Q15744

CEBPE, CCAAT/enhancer-binding protein epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPEQ15744 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEBPEQ15744 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms