Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRADDQ15628 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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