Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NCF4Q15080 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms