Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NCAPHQ15003 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NCAPHQ15003 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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