Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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ODF1Q14990 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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ODF1Q14990 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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ODF1Q14990 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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ODF1Q14990 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
ODF1Q14990 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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