Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SHROOM2Q13796 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
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SHROOM2Q13796 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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SHROOM2Q13796 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
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SHROOM2Q13796 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
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SHROOM2Q13796 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
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SHROOM2Q13796 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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SHROOM2Q13796 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
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SHROOM2Q13796 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
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