Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT88Q13099 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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