Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPS1Q13098 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPS1Q13098 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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