Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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NFX1Q12986 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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NFX1Q12986 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
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NFX1Q12986 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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NFX1Q12986 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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NFX1Q12986 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFX1Q12986 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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