Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CNTN1Q12860 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CNTN1Q12860 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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