Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLFN5Q08AF3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms