Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CHRNEQ04844 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CHRNEQ04844 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms