Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSBP1Q04837 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
SSBP1Q04837 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP1Q04837 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SSBP1Q04837 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms