Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
UBXN1Q04323 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN1Q04323 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN1Q04323 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN1Q04323 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN1Q04323 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN1Q04323 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN1Q04323 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN1Q04323 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN1Q04323 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN1Q04323 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
UBXN1Q04323 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms