Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
POU5F1Q01860 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms