Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTBN1Q01082 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTBN1Q01082 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms