Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVFC1P60507 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ERVFC1P60507 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms