Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
H2BFSP57053 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
H2BFSP57053 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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